工程抵款合同发生纠纷怎么办

工程抵款合同发生纠纷，具体的解决方法是：
一、和解，即双方在针对争议部分进行沟通后相互理解达成共识；
二、协调，是指在有关部门的协调下，对争议部分予以明确，使争议双方能够解决争议问题。
《民法典》第四百六十五条 依法成立的合同，受法律保护。
依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。