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不合法。
因为无论是总公司还是分公司，都是独立的营业执照和公章，除了隶属关系外，基本上没什么关系。
《 社会保险法》规定的用人单位的义务主要有两项：
一是办理社会保险登记，用人单位应当在成立时向当地社会保险经办机构申请办理社会保险登记，还应当自用工之日起三十日内为职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。
二是依法缴纳社会保险费，其中职工基本养老保险、职工基本医疗保险、失业保险的缴费义务由用人单位与职工共同承担，工伤保险、生育保险的缴费义务全部由用人单位承担。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位还应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。
二、分公司可以作为诉讼主体吗
分公司的法律性质定性为非法人，但是可以从事民事活动。
司法实践中，经常会遇到有限责任公司的分公司是否有诉讼主体资格的问题，对此有两种意见：一种意见认为，依照《民事诉讼法》第48条和《民事诉讼法意见》第40条第(5)项的规定，领取营业执照的分公司可以独立参加诉讼;另一种意见认为，《公司法》第14条第1款规定：公司可以设立分公司，分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担，故分公司不能参加诉讼，只能由公司参加诉讼，享受权利承担义务。
在公司治理中，由于工作和业务的需要，经常会在注册地外设立分公司，分公司的法律性质定性为非法人，但是可以从事民事活动。《公司法》第14条规定，有限责任公司可以设立分公司，分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。《民事诉讼法》第48条、《最高人民法院》第40条第(5)项规定，法人依法设立并领取营业执照的分支机构可以作为独立的民事诉讼主体。《公司法》的规定和《民事诉讼法》的规定并不矛盾，《公司法》解决的是实体民事责任的最终承担问题，而《民事诉讼法》规定的是诉讼主体资格的问题。有限责任公司的分公司依法设立，并领取营业执照，又有自己的财产，可以独立参加民事诉讼，以方便诉讼。当然，分公司参加诉讼，但是最终的民事权利义务实际上由有限责任公司享有和承担。
综合上面所说的，劳动合同一般和社保两者都是需要同一家公司来进行处理，如果两者分离的话，那么就会产生很大的风险，也会很容易引起劳动的纠纷，所以，分公司在进行处理的时候就要与总公司和劳动者协商好，这样才能更好的处理。